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陳水扁總統主持虎尾基地揭牌。

虎尾基地

早先雲林縣政府提供的土地並非今日的虎尾基地，而是土庫馬光農場、褒忠龍岩農場和東勢同安農場，這些都是台糖地，但周邊的相關條件並不理想。2001年9月23日，遴選委員為求審慎，在進行勘察時，詢問是否有更恰當的土地。張榮味縣長現場當即協商幕僚，進行處理，在確定高鐵特定區旁還留有大塊土地後，馬上就交派任務，要相關人員配合趕製作業。次日，當遴選委員登車離開前，全部資料在縣府工作人員的通宵達旦努力下，竟然及時完成。雲林縣府人員的指令明確、即知即行、高熱誠、高配合，讓遴選委員留下深刻印象。 2002年11月6日陳水扁總統親赴雲林，主持中科籌備處虎尾園區辦公室揭牌典禮，見證了中央與地方的這個美好的合作典範。
虎尾基地座落於雲林縣虎尾鎮西北側，臨新虎尾溪南側，西北接土庫鎮、二崙鄉，東臨高鐵雲林車站特定區。就地形和地勢言，其位於嘉南平原西北側，屬濁水溪沖積扇，由東向西略微傾斜，大致平坦，海拔49公尺。基地完整連接，公有土地佔0.89％；台糖土地則高達98.79％，循「先租後徵購」模式取得。私有土地僅佔0.32％，雲林縣政府於2004年11月12日公告徵收後，順利取得所有用地。
虎尾園區自2 0 0 4年第1標道路工程發包後，陸續完成自來水工程、電力及電信工程；至2006年底污水處理廠工程竣工時，區內公共工程已近90%完成。2007年3月20日中科「虎尾園區辦公室」掛牌，邀請國科會戴謙副主委、楊文科局長、陳銘煌副局長、郭坤明主任秘書，以及日商捷時雅邁科辻昭社長、元翎精密工業王德鑫董事長等揭牌，正式宣告這片舊稱「荒原三寮開墾地」的墾地里，即將成為嘉南地區最受期待的綠色科技城。

虎尾基地地形圖

虎尾基地開發前樣貌。

荒原三寮開墾地

中科三處基地在開發過程中，虎尾基地最為平和，主要原因或許在於地廣人稀，特別是虎尾基地所在地虎尾鎮墾地里。此地今日聲名大噪，但過去即使當地人士對這塊土地的歷史也不熟悉。 2003年5月縣府結合一群文史工作者加以研究、介紹，大眾才對此地有著初步的認識。
清朝時有三兄弟來此地養豬，蓋了三間草寮，故名「三寮」。虎尾台西客運創辦人黃朝深的父親黃茂盛曾押煙到北港販賣，經過溪埔時，眼見荒地遼闊而平坦，有意加以開墾，乃提出3年免租的規劃，除了建長隴「竹管厝」以招來佃農長住墾荒，又鑿「和順圳」引新虎尾溪水灌溉。不數年，終於開墾出5百餘甲良田。
日治時期，「三寮」變成「開墾地」，由於已是無主荒地，當局遂募農開墾。1938年，這裡出現新虎尾溪新生地上的「春日移民村」56戶，共有245人，開墾出323甲土地。
1945年台灣光復後，政府接收「三寮」成為台糖農場，放租農民耕作。1970年代這個區域曾是藥草專區，但在1990年代逐漸沒落，再加上位居虎尾最邊陲，居民又只有地上權而無土地權，因此公私兩方都無意發展，乃有「荒原三寮開墾地」之稱。
然而進入21世紀後，荒原頓時出現全新曙光，先是雲林縣政府將其劃入高鐵特區，而台大也聞風而至要求設立分校，最後則是中科虎尾基地確立。一如當年黃茂盛招佃開墾般，廣大空曠的土地，再次成為繁榮的基石。

2007年3月20日捷時雅邁科辻昭社長(右二)、國科會副主委戴謙(右三)、元翎董事長王德鑫(左二)、管理局局長楊文科(左三)、副局長陳銘煌(右一)和主任秘書郭坤明(左一)共同主持虎尾辦公室揭牌。

2006年11月9日籌備處舉辦虎尾村里長座談會。